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Southern杂交

来源:浙江大学生物学国家级实验教学示范中心

时间:2023-03-23 18:54:33

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【实验目的】

  通过分子杂交检测插入的外源DNA是否确实是所需克隆的目的基因片断。
【实验材料】

  经过完全酶切的基因组DNA

【试剂与器材】

  HindIII

  BamHI

  进口琼脂糖 (agarose):质量分数为0.8%1.5%

  10×TBE缓冲液:108g Tris55g硼酸,40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0),定容至1L。电泳时工作浓度为0.5×TBE缓冲液;

  溴化乙锭(ethidium bromide,EB):贮存浓度为0.5mg/ml,工作浓度为0.5mg/L

  6×上样缓冲液:0.25%溴酚蓝,40%蔗糖,10mmol/L EDTA(pH8.0)4℃保存;

  核酸标准Marker

  0.25mol/L HCl

  变性液:0.5mol/L NaOH 1.5mol/L NaCl

  中性液:0.5mol/L Tris-HClpH7.5),3mol/L NaCl

  20×SSC溶液:3mol/L NaCl3mol/L柠檬酸钠,用HClpH7.4

  2×SSC溶液;

  Dig标记和检测试剂盒;

  洗液:0.1mol/L马来酸,0.15mol/L NaCl,用固体NaOHpH7.5后,再加0.3% Tween 20

  检测缓冲液:0.1mol/L Tris-HCl0.1mol/L NaClpH9.5

  金属自动恒温加热器;超净工作台;微量移液器;常温离心机;冰箱;核酸电泳仪;制冰机;离心管;枪头;核酸电泳槽。硝酸纤维素膜或尼龙膜;烘箱;常温摇床;分子杂交仪;

【实验思考题】

  1.在进行Southern印迹杂交时,DNA酶切反应不彻底会有何影响? DNA发生降解又有何影响?

  2.在进行转膜时应注意什么问题?

  3.怎样防止毛细作用引发的短路?

  4.如何将转移后的DNA固定在膜上?