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质粒DNA的微量制备及电泳检测

来源:浙江大学生物学国家级实验教学示范中心

时间:2023-03-22 23:11:16

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【实验目的】

掌握质粒DNA的抽提技术,学习琼脂糖凝胶电泳电泳的操作方法和技术

 

【主要仪器】

1.恒温培养箱          

2.恒温摇床

3.高压灭菌锅                 

4.台式离心机

5.干式恒温器              

6.振荡器;

7.电泳仪及电泳槽

8.紫外检测仪

   

【实验材料及试剂】

1.含重组质粒菌种

2LB液体培养基 

3. 氨苄青霉素:100mg/ml

4. 溶液Ⅰ,

5.溶液Ⅱ,

6 .溶液Ⅲ ,

7 ..酚:氯仿:异戊醇(25241),

8 .无水乙醇,70%乙醇

9. TE缓冲液(pH 8. 0),

10. RNaseA1mg/ml),

11. 0.5×TBE缓冲液(pH8.0),

12. 琼脂糖,

13. 6×加样缓冲液,

14 . 1mg/ml溴化乙锭(EB),

 

【实验内容】

一、收集菌体

1) 取1ml的过夜培养菌液加入1.5ml离心管中,8000r/min离心1min

2) 弃上清液, 保留菌体沉淀,将管倒置于滤纸上数分钟,使液体尽可能流尽。

3 收集菌体沉淀,用旋涡混合器将菌体重悬浮于100ul溶液Ⅰ(TEG缓冲溶液,含溶菌酶)中,冰浴放置10min

4 加入200 ul新鲜配置的碱裂解液(溶液Ⅱ)迅速盖紧管盖轻轻颠倒数次(不可振荡!!),混匀内容物并使之变清,冰浴放置5min

二、分离纯化质粒DNA

1)加入150 ul冰冷却的乙酸钾溶液(溶液Ⅲ),加盖迅速轻轻颠倒数次(不可振荡),混合均匀,冰浴放置10min,使沉淀完全。12000 rpm4℃下离心10min

2)上清液移入另一干净离心管中,加等体积的(试剂取下层)/氯仿(11)反复振荡(约20次),混匀后,12000 rpm4℃下 离心10min

3)上清液移入另一干净离心管中,加入2倍体积的无水乙醇,混匀后于室温放置20 min

412000 rpm4℃下 离心10min,弃上清液,将管口打开,倒置于滤纸上使所有液体尽可能流出。

5       加入1ml 70%乙醇稍洗沉淀一次(动作要轻,也可离心)。

6       弃上清液,打开管口,倒置于滤纸上使所有液体流尽 ,室温干燥15 min

7       将沉淀溶于30 ul(或40 ul TE缓冲液(pH8.0,含20mg/LRNase)中,置37℃恒温水浴中保温30 min(可于-20℃保存备用)。

    三、琼脂糖凝胶电泳
1)制胶
1%琼脂糖凝胶实验室已制备)

2)加样

           5ul纯化的质粒DNA样品,与1ul 6×电泳加样缓冲液混匀,用微量移液枪小心加入样品槽中。

3)电泳

          加完样后,盖上电泳槽盖,立即接通电源,使电压调到100V,恒压电泳。当溴酚蓝条带移动到距凝胶前缘约2cm时,停止电泳。

4)观察和拍照

        取出胶块置于紫外灯下观察,DNA存在处可显示出肉眼可辨的橘红色荧光带,用凝胶成像仪进行拍照。

【实验记录与报告】

        分析质粒DNA电泳检测结果。

【实验思考题】

        在提取质粒DNA的过程中EDTA SDS NaOH、乙酸钾、酚-氯仿-异戊醇等试剂的作用是什么?