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PCR技术(三):Taq DNA聚合酶

发表人:吴敏,发布时间:09-02-03
 

Taq DNA聚合酶是从一种水生栖热菌(Thermusaquaticus)yT1株分离提取的.yT 一种嗜热真菌,能在7075生长.该菌是1969年从美国黄石国家森林公园火山温泉 中分离的.

()酶活性与热稳定性

  该酶基因全长2496个碱基,编码832个氨基酸,酶蛋白分子为 94KDa.其比活性为200000单位/mg.7580时每个酶分子每秒钟可延伸约150个核苷 酸,70延伸率大于60个核苷酸/秒,55时为24个核苷酸/.温度过高(90以上) 或过低(22)都可影响Taq DNA聚合酶的活性,该酶虽然在90以上几乎无DNA合成, 但确有良好的热稳定性,在PCR循环的高温条件下仍能保持较高的活性.92.595 97.5时,PCR混合物中的Taq DNA聚合酶分别经130min40min56min后,仍可 保持50%的活性,实验表明.PCR反应时变性温度为9520sec50个循环后,Taq DNA聚合酶仍有65%的活性.Taq DNA聚合酶的热稳定性是该酶用于PCR反应的前提条 件,也是PCR反应能迅速发展和广泛应用的原因.Taq DNA聚合酶还具有逆转录活性, 其作用于类似逆转录酶.此活性温度一般为6568,有Mn2+存在时,其逆转录活性 更高.

()离子依赖性

  aqDNA聚合酶是Mg2+依赖性酶,该酶的催化活性对Mg2+浓度非常敏感.以活性程度 很低的鲑鱼精子DNA为模板,dNTP的浓度为0.70.8mmol/L时,用不同浓度Mg2+进行 PCR反应10min,测定结果为Mgcl2浓度在2.0mmol/L时该酶催化活性最高,此浓度能最 大限度地激活TaqDNA聚合酶的活性,Mg2+过高就抑制酶活性,当Mgcl2浓度在 10mmol/L时可抑制4050%的酶活性.由于Mg2+能与dNTP结合而影响PCR反应液中游离 Mg2+浓度,因而Mgcl2的浓度在不同的反应体系中应适当调整,优化浓度.一般反应 Mg2+浓度至少应比dNTP总浓度高0.51.0mmol/L.适当浓度的KCL能使Taq DNA聚合 酶的催化活性提高5060%,其最适浓度为50mmol/L,高于75mmol/L时明显抑制该酶 的活性.

()忠实性

  TaqDNA聚合酶具有5'→3'聚合酶活性和5'→3'外切酶活性,而无3'→5'外切活 性,它不具有Klenow酶的3'→5'校对活性.因而,在PCR反应中如发生某些碱基的错 配,该酶是没有校正功能的.Taq DNA聚合酶的碱基错配机率为2.1×10-4.

()抑制剂

  低浓度的尿素、甲酰胺、二甲基甲酰胺(DMF)和二甲基亚砜(DMSD)Taq DNA聚合酶的 催化活性并无影响.极低浓度的离子表面活性剂如脱氧胆胺酸钠(小于0.06%),十二烷 基肌氨酸钠(小于0.02%),十二烷基硫酸钠(SDS,小于0.01%)几乎可完全抑制该酶的 活性.而非离子表面活性剂在较高浓度(Tween20NP-40.Tritox-100)>5%时方能 抑制该酶的活性.

变性剂对TaqDNA聚合酶活性的影响

变性剂

浓度

活性(%)

乙醇

3%

100

 

10%

110

尿素

0.5mol/L

100

 

1.0mol/L

118

 

1.5mol/L

107

 

2.0mol/L

82

DMSO

1%

100

 

10%

53

 

20%

11

DMF

5%

100

 

10%

82

 

20%

17

甲酰胺

1%

100

 

15%

86

 

20%

39

SDS

0.001%

105

 

0.01%

10

 

0.1%

0.1

  低浓度的NP-40(0.05%)Tween20(0.05%)能增强TaqDNA聚合酶的活性.低浓度SDS 该酶的抑制作用可加入一定浓度的NP-40Tween20抵消.TaqDNA聚合酶可在-20 存至少6个月.

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